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中医和西医对人体系统的描述有很大的差异,西医将人体分为各个器官,并将一些相关的器官组成系统,例如循环系统、消化系统、呼吸系统、运动系统、内分泌系统、生殖系统、免疫系统等七大系统。在各个系统之间并没有太大的相关性,各个脏器之间也没有太多的连系,好像每个脏器或系统都是独立的。
中医就完全不同了,大分类只有五脏六腑,每一个脏腑都有一条相关的经络。除了五脏六腑对应的十一条经络之外,另外还有心包经、任脉和督脉三条经络,一共是十四条主要的经络。各个经络还有分支,称之为经别,几乎遍及全身。每条经络上有穴位,针灸治疗时,主要是刺激经络上的穴位。
除了个别脏腑和其相应经络之间存在着紧密的关系之外,各个脏腑之间也存在着非常密切的相生相克关系,中医将之归纳出五行理论。五行理论不但说明了脏腑之间的关系,同时也将各个脏腑和气候变化之间的关系解释得非常透彻合理。
比较中、西医对人体系统的描述,可以看出,中医是累积了数千年人类经验所形成的智慧,有比较合理而且慎密的逻辑和结构,也因此能够延用数千年。
中医的观点中,人体是一体的,五脏六腑之间互相有非常紧密的关系,而且是平衡的。同时除了解剖学所提到的硬件之外,中医更有许多概念性或功能性的系统,例如能量系统、资源管理系统等。这些系统在过去科技能力不足,没有仪器量测的年代,由于缺乏数字概念,医书中只能用各种各样的文字来描述这些系统。如能量系统就用阴、阳、虚、实、血气和火来描述;资源管理系统则用相生相克、平衡及其它的方式来描述。由于这些描述和现代科学精确的数据化用语有很大的差异,使得整个中医看起来很像难以理解的玄学。